秒針が目盛りから微妙にずれています。

歯車どうしの間に設けられている "あそび" によって微妙なずれが発生したことが考えられます。
ある程度のずれは起こり、異常ではありません。

詳細情報

自動車のハンドルに "あそび" があるように、時計の歯車どうしの噛合い部分にも、時計を衝撃から守り、歯車が滑らかに動くための隙間があります。

この隙間を「バックラッシュ」といいます。
バックラッシュは大きすぎても小さすぎてもダメで、適度な大きさに設計されます。